据台湾媒体报道，国民党主席马英九特别费案即将侦结，国民党廉能委员会六人小组也已完成调查报告，认定马英九无贪污侵占行为。但值得注意的是，报告也显示，若采较严格标准，扣除竞选补助和检方展开调查后的捐款，则马英九的公益捐款和特别费间会产生近398万元的款项缺口。

　　据报道，马英九去年11月自请国民党廉能委员会对他的特别费案进行调查，廉能会随即指派王清峰、赵昌平、马以工、余致力、王光宇、李伸一组成六人调查小组，王清峰担任召集人。小组成员连续在1月17、19、21、29、31日等五天就调查报告草稿密集会商，终于达成共识，作成报告结论。

　　整份调查报告循“监察院”调查报告模式，分成调查规范、调查范围、调查事实、调查意见和调查结果等项。调查报告认定，马英九并无贪污侵占行为，8年市长任期公益捐款6800余万元（新台币，下同），已逾特别费1500余万元总数。

　　调查小组调查显示，马英九从1999年至2006年市长八年任内共捐款223笔，计捐款6334万9529元；加上夫人周美青所捐的13笔、474万5381元，共达6809万4910元，即马英九去年卸任前，在特别费案爆发后，在会计师周志诚查核“挂保证”公布的捐款总数。

　　至于马英九八年市长任内的特别费总额则是1547万4387元，就调查小组调查了解，马英九在1999年2月22日以竞选补贴捐助1300万元和1200万元，分别设立新台湾人基金会和敦安基金会；2002年连任，在2003年1月12日又分别捐款两基金会各1000万元，根据小组调查，也认定来自竞选补贴，因此，马英九以竞选补贴款项共捐款4500万元。

　　又马英九特别费案爆发，在检察官展开调查后，马英九在去年的11月17日和22日先后捐款达1150万元。因此，调查小组在调查报告中认定，“首长特别费”本可全数用于捐赠，马英九在八年市长任内的公益捐赠6800余万元，远远超过任内已领据支领的1500多万元特别费总数，已将所有特别费涵盖；“实难认定有贪污侵占之故意及行为”。

　　不过，小组成员在调查报告中也如实指出，若考虑社会质疑其中4500万元捐款系来自竞选补助款，又去年11月17日和22日所捐出的1150万元是在检方已展开特别费调查后，若以较严格标准，将马英九任内6800余万元的捐款扣除该二部分款项，亦尚有1149万4910元的公益捐款。

　　若以八年马英九特别费总数1547万余元，与调查小组统计出来的八年公益捐款，以从严审订数额1149万余元相较，尚有397万9477元的款项缺口。

　　但因调查小组认为，该部分特别费系领据核销，并不需要收据，亦且在调查过程中，小组成员们也发现，马英九亦常有未对外说明或收取收据的公益捐款。如去年11月8日马英九以自己和母亲秦厚修名义捐助两部各173万元的复康巴士，其中以母亲名义捐赠者未记入捐赠金额，又曾捐助海外重要“民主人士”等，多笔无法披露受款人和不复记忆的公益捐款，应足以弭平其间金额差距。